第十六章 GCCGCCAGTTCC (第1/2页)

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傍晚，他被接二连三的电话吵醒。三家测序公司全都散发着大号拖延症的气质，像是约好了一样，在承诺时效的前一天晚上才和他沟通。

沟通的内容无非就是怀疑样本被污染了，所以提前声明不对测序结果的解读负责。

卢赫见怪不怪地一顿“嗯嗯啊啊好好好”迅速把他们都给打发了，随后邮箱被测序报告塞满。

他从床上爬起来，穿戴整齐，甚至用梳子蘸水梳了头发。

随后他郑重地走下楼，走进细胞间，一屁股坐在电脑前，伸手去手捞椅背，把正在忙碌的菜菜一把拽了过来。

“歇会儿歇会儿，陪我吃瓜。”

这次他们率先打开了基因组原始数据。基准30亿个碱基对，有效分析了30亿个碱基对。Gc含量57%。

怎么还是这么高？

两人的脑袋凑在一起，紧盯着屏幕上缓缓滑过的密密麻麻的字符。这次依然是满屏的红和绿，但红多绿少。

“停！”菜菜指着刚掠过的一段字符惊呼，“你看这段，GccGccAGttcc，这不是终止子吗？”

卢赫定睛一看，“是啊，这是转录终止修饰点，而且是依赖Rho因子[1]的的转录终止。”

“终止，好多终止，全是终止！”菜菜又一次惊呼，“停！这段，Gc区[2]下游怎么没有tAtA区[3]啊。我只知道组蛋白可以没有Gc区，这没有tAtA区的是什么鬼啊？”

鼠标继续翻动，两人逐渐陷入沉默。

许久之后，卢赫打破了这死寂的气氛，但从他嘴里说出的并不是菜菜所期待的正经话。

“真是离谱他妈给离谱开门，离谱到家了。”他边感慨边点开了刚刚下载好的线粒体基因，在软件加载期间合了好几下眼。

软件加载完成，线粒体基因没有太多注释，可翻了几下后，两人还是犹如半截木头般僵在那里。从地下室天窗投射出的一缕橙红色的阳光，缓缓从卢赫的脸上掠过，他连眼睛都没眨一下。

渐渐的，天色完全暗下来，电脑屏幕上反射出天花板上白炽灯管的轮廓，正好遮挡住屏幕的正中央。

“GGAGGGcGAGGctccGtcctAGccttG。。。”卢赫偏了偏头，默念着其中的一段碱基序列，重启电脑进了Linux，然后在命令行下快速敲击。

一顿操作下来，他揉着脖子对着黑色背景下一格一格往前爬的亮白色进度条沉思。一旁的菜菜眯着眼睛念出命令行中的小字：“cRISpR。。。cas。。。Finder？你不会真以为他会有cRISpR系统吧？这太荒诞了。”

卢赫揉乱了自己的头发，“葫芦上藤上结南瓜。咱们搞研究的，总得有点儿想象力吧。”

不一会儿，软件装好了。他在命令行敲出一大行命令：perl cRISpRcasFinder.pl -in Stupid_turtle.fna -out Stupid_turtle_crispr_cas -def General -cas -ccvr -ccc -gscf -keep -html -cpum 32 -cpup 32 -xr 555 -md 50 -t 50

按下回车键后，藏在桌子背面的大机箱嗡嗡地运转了起来。

“法国人搞出来的开源软件，能预测cRISpR序列和cas的位置。他究竟是不是大细菌，是什么样的大细菌，等会儿一目了然。”

他说完戳了戳还在发愣的菜菜，“喂，怎么还僵着呢。你对新事物的接受能力完全不行啊。看来老呆在这儿干体力活也不行，回头你每周给我做两次文献汇报吧。记得看最新的，保准跟科幻小说一样给你看得一愣一愣的。”

进度条一点一点往前走，即将100%。菜菜目不转睛神色紧张，好像那些闪烁跳跃的格子是追在她身后的怪物，“你别说话了，我紧张，万一他是外星人怎么办？”

“哈哈。”卢赫笑出声来，“你可真是太保守了，你应该这样想：万一他不是人怎么办？你之前不是说他是大细菌吗？”

正说着，软件运行完毕，一个本地网页自动弹了出来。

confirmed cRISpRs： 31

Id: 01

cRISpR start position: